MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015942	GC	4	8	130161	130168	0 %	0 %	50 %	50 %	344198352
2502	NC_015942	CGG	2	6	130194	130199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2503	NC_015942	GTT	2	6	130285	130290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198352
2504	NC_015942	TGC	2	6	130295	130300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2505	NC_015942	CGT	2	6	130309	130314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2506	NC_015942	TGT	2	6	130320	130325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198352
2507	NC_015942	AGC	2	6	130376	130381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2508	NC_015942	CGGG	2	8	130394	130401	0 %	0 %	75 %	25 %	344198352
2509	NC_015942	CAG	2	6	130414	130419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2510	NC_015942	GCT	2	6	130432	130437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2511	NC_015942	CCG	2	6	130455	130460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198352
2512	NC_015942	GCG	2	6	130469	130474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2513	NC_015942	CCAG	2	8	130479	130486	25 %	0 %	25 %	50 %	344198352
2514	NC_015942	CTG	2	6	130554	130559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2515	NC_015942	CCG	2	6	130560	130565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198352
2516	NC_015942	CGC	2	6	130569	130574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198352
2517	NC_015942	GCG	2	6	130601	130606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2518	NC_015942	CTGGCC	2	12	130628	130639	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344198352
2519	NC_015942	TGG	2	6	130647	130652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198352
2520	NC_015942	GGC	2	6	130693	130698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2521	NC_015942	GCA	2	6	130716	130721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2522	NC_015942	CGG	2	6	130773	130778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2523	NC_015942	CTG	2	6	130837	130842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2524	NC_015942	CAG	2	6	130843	130848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2525	NC_015942	GGC	2	6	130875	130880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2526	NC_015942	CAA	2	6	130900	130905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198352
2527	NC_015942	GGC	2	6	130909	130914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2528	NC_015942	GATG	2	8	130926	130933	25 %	25 %	50 %	0 %	344198352
2529	NC_015942	TGG	2	6	130937	130942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198352
2530	NC_015942	GA	3	6	130979	130984	50 %	0 %	50 %	0 %	344198352
2531	NC_015942	AGT	2	6	131063	131068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198352
2532	NC_015942	AGGGCG	2	12	131072	131083	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	344198352
2533	NC_015942	GGC	2	6	131091	131096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2534	NC_015942	CCAG	2	8	131124	131131	25 %	0 %	25 %	50 %	344198352
2535	NC_015942	GA	3	6	131180	131185	50 %	0 %	50 %	0 %	344198352
2536	NC_015942	GGC	2	6	131202	131207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2537	NC_015942	GGC	2	6	131230	131235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2538	NC_015942	CGG	2	6	131313	131318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2539	NC_015942	CTG	2	6	131349	131354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2540	NC_015942	CAG	2	6	131365	131370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2541	NC_015942	GTGA	2	8	131390	131397	25 %	25 %	50 %	0 %	344198352
2542	NC_015942	TGC	2	6	131404	131409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2543	NC_015942	GGGC	2	8	131427	131434	0 %	0 %	75 %	25 %	344198352
2544	NC_015942	GT	3	6	131543	131548	0 %	50 %	50 %	0 %	344198352
2545	NC_015942	CGG	3	9	131550	131558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
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2547	NC_015942	GAGCAG	2	12	131713	131724	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	344198352
2548	NC_015942	CGG	2	6	131742	131747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2549	NC_015942	GTC	2	6	131758	131763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2550	NC_015942	TCG	2	6	131801	131806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2551	NC_015942	GCG	2	6	131813	131818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2552	NC_015942	GGCG	2	8	131835	131842	0 %	0 %	75 %	25 %	344198352
2553	NC_015942	GCA	2	6	131871	131876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2554	NC_015942	GGC	3	9	131959	131967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2555	NC_015942	TTG	2	6	132001	132006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198352
2556	NC_015942	G	6	6	132055	132060	0 %	0 %	100 %	0 %	344198352
2557	NC_015942	TTG	2	6	132080	132085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198352
2558	NC_015942	TCA	2	6	132134	132139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198352
2559	NC_015942	CAT	2	6	132282	132287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198352
2560	NC_015942	CCG	2	6	132291	132296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198352
2561	NC_015942	GGC	2	6	132313	132318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2562	NC_015942	GCC	2	6	132324	132329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198352
2563	NC_015942	CGG	3	9	132342	132350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2564	NC_015942	GGGC	2	8	132378	132385	0 %	0 %	75 %	25 %	344198352
2565	NC_015942	TGC	2	6	132422	132427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2566	NC_015942	GGGC	2	8	132468	132475	0 %	0 %	75 %	25 %	344198352
2567	NC_015942	GCC	2	6	132498	132503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198352
2568	NC_015942	CGT	2	6	132519	132524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2569	NC_015942	AGC	2	6	132548	132553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2570	NC_015942	CGG	2	6	132651	132656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2571	NC_015942	CAG	2	6	132712	132717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198352
2572	NC_015942	GGC	2	6	132772	132777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2573	NC_015942	GGC	2	6	132820	132825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2574	NC_015942	TCA	2	6	132837	132842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198352
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2577	NC_015942	GGC	2	6	132969	132974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198352
2578	NC_015942	TGC	2	6	133118	133123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198353
2579	NC_015942	GTG	2	6	133129	133134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198353
2580	NC_015942	CGT	2	6	133199	133204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198353
2581	NC_015942	CAG	2	6	133296	133301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198353
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2583	NC_015942	CAA	2	6	133367	133372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198353
2584	NC_015942	CAGCG	2	10	133376	133385	20 %	0 %	40 %	40 %	344198353
2585	NC_015942	TTG	2	6	133410	133415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198353
2586	NC_015942	GCG	2	6	133426	133431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198353
2587	NC_015942	T	6	6	133449	133454	0 %	100 %	0 %	0 %	344198353
2588	NC_015942	CAG	2	6	133467	133472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198353
2589	NC_015942	ATA	2	6	133570	133575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198353
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2591	NC_015942	CGT	2	6	133643	133648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198353
2592	NC_015942	CGC	2	6	133671	133676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198353
2593	NC_015942	CGCTG	2	10	133700	133709	0 %	20 %	40 %	40 %	344198353
2594	NC_015942	T	7	7	133747	133753	0 %	100 %	0 %	0 %	344198353
2595	NC_015942	TCG	2	6	133816	133821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198353
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2597	NC_015942	TCT	2	6	133837	133842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198353
2598	NC_015942	GCG	2	6	133920	133925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198353
2599	NC_015942	G	6	6	133925	133930	0 %	0 %	100 %	0 %	344198353
2600	NC_015942	GC	3	6	133952	133957	0 %	0 %	50 %	50 %	344198353
2601	NC_015942	CAG	2	6	134127	134132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198353
2602	NC_015942	AG	3	6	134131	134136	50 %	0 %	50 %	0 %	344198353
2603	NC_015942	GTT	2	6	134151	134156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198353
2604	NC_015942	AGG	2	6	134206	134211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198353
2605	NC_015942	GTC	2	6	134232	134237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198353
2606	NC_015942	GGGC	2	8	134260	134267	0 %	0 %	75 %	25 %	344198353
2607	NC_015942	GCAG	2	8	134342	134349	25 %	0 %	50 %	25 %	344198353
2608	NC_015942	CG	3	6	134367	134372	0 %	0 %	50 %	50 %	344198353
2609	NC_015942	AGG	2	6	134380	134385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198353
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2611	NC_015942	CCAG	2	8	134447	134454	25 %	0 %	25 %	50 %	344198353
2612	NC_015942	GCC	2	6	134497	134502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198353
2613	NC_015942	AGG	2	6	134548	134553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198353
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2616	NC_015942	GAG	2	6	134694	134699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198353
2617	NC_015942	GCG	2	6	134701	134706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198353
2618	NC_015942	GCCC	2	8	134711	134718	0 %	0 %	25 %	75 %	344198353
2619	NC_015942	GCG	2	6	134839	134844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198353
2620	NC_015942	GTT	2	6	134846	134851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198353
2621	NC_015942	TGC	2	6	134893	134898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198353
2622	NC_015942	TCC	2	6	134911	134916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198353
2623	NC_015942	GCA	2	6	135002	135007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198353
2624	NC_015942	TCG	2	6	135037	135042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198353
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2650	NC_015942	TCC	2	6	136623	136628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198354
2651	NC_015942	GGGCT	2	10	136650	136659	0 %	20 %	60 %	20 %	344198354
2652	NC_015942	GTG	2	6	136680	136685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198354
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2654	NC_015942	G	7	7	136795	136801	0 %	0 %	100 %	0 %	344198354
2655	NC_015942	CTGC	2	8	136888	136895	0 %	25 %	25 %	50 %	344198354
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2723	NC_015942	TGA	2	6	140328	140333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198358
2724	NC_015942	ACG	2	6	140372	140377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198358
2725	NC_015942	GACGC	2	10	140517	140526	20 %	0 %	40 %	40 %	344198358
2726	NC_015942	CGA	2	6	140544	140549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198358
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2728	NC_015942	GA	3	6	140957	140962	50 %	0 %	50 %	0 %	344198359
2729	NC_015942	ATCG	2	8	140983	140990	25 %	25 %	25 %	25 %	344198359
2730	NC_015942	GGT	2	6	141009	141014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198359
2731	NC_015942	TGG	2	6	141083	141088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198359
2732	NC_015942	CAT	2	6	141121	141126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198359
2733	NC_015942	GGT	2	6	141132	141137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198359
2734	NC_015942	GGCA	2	8	141140	141147	25 %	0 %	50 %	25 %	344198359
2735	NC_015942	CTT	2	6	141155	141160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198359
2736	NC_015942	AC	3	6	141211	141216	50 %	0 %	0 %	50 %	344198359
2737	NC_015942	GCA	2	6	141221	141226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198359
2738	NC_015942	GCG	2	6	141227	141232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198359
2739	NC_015942	TGC	2	6	141242	141247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198359
2740	NC_015942	GCT	2	6	141282	141287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198359
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2742	NC_015942	G	7	7	141315	141321	0 %	0 %	100 %	0 %	344198359
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2854	NC_015942	GGGGA	2	10	147562	147571	20 %	0 %	80 %	0 %	344198366
2855	NC_015942	TGC	2	6	147590	147595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198366
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2859	NC_015942	TGCA	2	8	147946	147953	25 %	25 %	25 %	25 %	344198366
2860	NC_015942	GAT	2	6	147972	147977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198366
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2982	NC_015942	GCA	2	6	153437	153442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198373
2983	NC_015942	GCC	2	6	153524	153529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198373
2984	NC_015942	AGG	2	6	153581	153586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198373
2985	NC_015942	GGCT	2	8	153620	153627	0 %	25 %	50 %	25 %	344198374
2986	NC_015942	TCC	2	6	153629	153634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198374
2987	NC_015942	CGC	2	6	153702	153707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198374
2988	NC_015942	ATC	2	6	153725	153730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198374
2989	NC_015942	GCACGC	2	12	153780	153791	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344198374
2990	NC_015942	TCA	2	6	153807	153812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198374
2991	NC_015942	GCGGT	2	10	153833	153842	0 %	20 %	60 %	20 %	344198374
2992	NC_015942	GACCG	2	10	153877	153886	20 %	0 %	40 %	40 %	344198374
2993	NC_015942	GCC	2	6	153895	153900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198374
2994	NC_015942	GCC	3	9	153922	153930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198374
2995	NC_015942	GCG	2	6	154048	154053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198374
2996	NC_015942	GCC	2	6	154093	154098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198374
2997	NC_015942	GGA	2	6	154099	154104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198374
2998	NC_015942	TTC	2	6	154120	154125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198374
2999	NC_015942	ATA	2	6	154292	154297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198374
3000	NC_015942	CCA	2	6	154338	154343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198374

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